教育のかたわら、医師として多くの患者を診療したポンペ。国籍や身分で区別せず、貧しい人は無料で診察した彼の行いは、民主国家オランダでは当然のことながら、身分制度の厳しい当時の日本では考えられないものでした。
　「ひとたびこの職務を選んだ以上、もはや医師は自分自身のものではなく、病める人のものである」
　医療の真髄を説いたポンペの医戒は、封建社会に育った門弟たちに驚きと感動を持って受け止められました。

　当時の長崎はコレラが蔓延しており、多くの人々が待ち望んだのが近代医療を施す病院、小島養生所の設立でした。医学校に附設された養生所は124床を持ち、患者の治療とともに臨床講義を行う、今でいう大学病院の原型でした。大仕事を終えて帰国したポンペの志は後任のボードインが引き継ぎ、化学や物理を専門に教える「分析窮理所」を附設します。ここに赴任した理化学教師ハラタマの教える最新の自然科学を学ぼうと、さらに日本中から学生が集まります。養生所は「精得館」と改名しながら、明治維新を挟んだ前後、黎明期の日本の近代医学・薬学教育と、自然科学教育の礎となりました。
　精得館で教えたオランダ人医師たちは、後に全国の医学校や理化学校の創設にも尽力します。彼らの門弟たちも近代医学の普及に活躍しました。ポンペの右腕として養生所設立の立役者となった松本良順は、江戸の医学所頭取を経て維新後は初代陸軍軍医総監を務め、肉食、牛乳や衛生思想の普及に努力しました。相良知安と岩佐純は東京大学医学部の前身である大学東校を設立、日本の医学教育にドイツ医学を採用しました。岩倉具視遣欧使節団として渡欧した長与専斎は、帰国後、人民の健康をまもる公衆衛生行政を確立しました。また、緒方惟準（緒方洪庵の次男）は大阪大学医学部の前身である大坂医学校をボードインとともに設立しました。
　養生所で学んだ若人が、日本の近代医学・薬学を成立させ、民主的な考え方を身につけて人民の健康をまもる公衆衛生行政を確立したのです。

　長崎大学医学部の創立記念日は11月12日です。これは1857年に長崎奉行所西役所でポンペが医学の講義を始めた近代医学教育発祥の日が由来です。日本最古の歴史を誇り、2017年創立160年を迎えました。その長い歩みのなかで、ノーベル化学賞を受賞した下村脩博士をはじめとする貴重な人材も多く輩出してきました。